警告和改进的PCR检测罗非鱼湖病毒(TiLV)病泰国罗非鱼养殖场方法
H T。东,S. Siriroob,W. Meemetta,W. Santimanawong,W. Gangnonngiw,N. Pirarat,P. Khunrae,T. Rattanarojpong,R. Vanichviriyakit和S. Senapin |2017年4月20日|2872次下载|.PDF |242.8 KB |标签:淡水鱼类,健康,泰国
罗非鱼湖病毒(TiLV)是一种新型的RNA病毒类似正粘病毒。据报道,作为一种新兴的病毒引起罗非鱼(SHT)在以色列,厄瓜多尔,哥伦比亚和埃及(弗格森等人的合胞肝炎2014; Eyngor等2014;巴哈拉赫等人2016年,德尔 - 波索等人2017年,法特希等人2017)。本病引起的大量死亡高达90%,在养殖罗非鱼,被认为是全球罗非鱼养殖的潜在威胁(Eyngor等人。2014)。
在泰国的罗非鱼养殖场,疾病的暴发最近发生高累积死亡率(20-90%)有关,我们发现病鱼表现SHT的典型组织病理学特征。感染已被证实透射电子显微镜(TEM),在从以色列原位杂交和高核苷酸序列同一性TiLV(Dong等人。2017年)。我们的研究进程通过使用先前由Eyngor等发表巢式RT-PCR引物序列的延迟。(2014)与后由Tsofack等人发布的详述RT-PCR方案在一起。(2016)。我们的初步检测测定使用具有假定PCR条件早期报告(Eyngor等人2014)(在出版物中未指定)导致的非特异性鱼基因扩增进行。这可能是由于一个事实,即13-18出的20个核苷酸的引物“嵌套EXT-2”匹配的鱼的基因。因此,我们修改了巢式RT-PCR方案成半巢式RT-PCR通过省略引物“嵌套EXT-2”,以避免假阳性结果。
下面给出的半巢式RT-PCR方案可自由地用于非商业应用,以检测TiLV。重感染的样品将产生415 bp和250bp的扩增子2个频带同时轻轻感染的样品将产生单一的250-bp的扩增条带(图1)。由于这是TiLV在亚洲的第一份报告,作者敦促亚洲鱼类健康实验室测试TiLV当罗非鱼死亡率异常发生。请联系Centex的虾(saengchan“在” biotec.or.th)获得阳性对照质粒(的pGEM-415_bp),这将用于非商业组织提供免费和收费的私营部门。
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